De 1988 até dezembro de 2004, a Secretaria Municipal de Saúde era a responsável pela gestão do SUS no município. A partir de janeiro de 2005, através da lei 1509 de 30 de dezembro de 2004, foi criada a Fundação de Saúde de Angra dos Reis (FuSAR), que passou a responder pelo controle e aplicação de recursos SUS.
A rede pública de saúde em Angra dos Reis, organizada em 5 Distritos Sanitários, conta com a seguinte estrutura: 12 Unidades Básicas de Saúde (UBS), 6 unidades de Pronto Atendimento(SPA), incluindo o Pronto Atendimento Infantil (PAI), 1 Pronto Socorro Geral, 1 Centro de Especialidades Médicas (CEM), 1 Centro de Especialidades Odontológicas (CEO), 25 Módulos do Programa Saúde da Família, 05 equipes do PACS, 1 Laboratório Central, 2 Hospitais Conveniados, 1 Centro de Atenção Psicossocial (CAPS II) e 1 Hemonúcleo.
O número total de leitos hospitalares disponíveis em Angra dos Reis é de 285, distribuídos em 04 estabelecimentos de saúde, conforme tabela abaixo.