Criada em 2005, a Secretaria Municipal de Pesca, visa dar um tratamento diferenciado e especializado ao segmento da pesca e maricultura. Seu objetivo é fomentar as atividades ligadas a pesca e maricultura tendo como base à participação efetiva da população local, de forma a atender pescadores e maricultores tradicionais em seus valores sociais, políticos e culturais.

Em muitas de suas ações foi criado o Conselho Municipal da Aqüicultura e Pesca, órgão que discutirá diretamente junto com a Secretaria de Pesca as políticas voltadas para o setor.

Desde 1992 com a antiga Secretaria de Agricultura e Pesca vem sendo realizada a estatística pesqueira, trabalho de vital importância que confere a Angra o título de 1º produtor de sardinha e o 2º de camarão no Estado. Este trabalho contribui para o agrupamento de dados da evolução pesqueira em todo o estado e serve de subsidio para pescadores na busca de comprovação documental de sua atividade junto a órgãos federais.

A Secretaria de Pesca recebe toda parte documental para armadores, pescadores e embarcações a fim de legalizar sua atividade junto ao órgão Federal – SEAP e também apóia os pescadores e armadores junto aos Bancos para obtenção de linhas de crédito. Ordena e mantêm, em toda comunidade pesqueira seus cais, pontes, passarelas e servidões, de fundamental importância para o embarque e desembarque de material de pesca e do pescado. Tem fomentado a atividade de maricultura para ilhéus e pescadores artesanais de baixa renda com fonte alternativa de trabalho e renda, contribuindo para a fixação do ilhéu em seu local de origem e diminuindo o êxodos das comunidades caiçaras.

O trabalho de fomento a maricultura deu a Angra dos Reis o status de maior produtor de moluscos marinhos (mexilhões, ostras e coquille) do estado e o maior produtor de coquille do país.